Analyse mikrobieller Populationen

Analyse mikrobieller Populationen mit MALDI-TOF-MS

Im Rahmen des Projektes wird eine Charakterisierung des kultivierbaren Anteils von Mikroorganismen in Populationen aus Umweltproben durchgeführt. Dazu werden zwei Methoden verwendet. Erstens MALDI-TOF-MS, eine sehr schnelle und effiziente Methode zur Identifizierung von Mikroorganismen, die bisher im Bereich der Populationsanalytik noch nicht häufig eingesetzt wird. Hier ist eine Identifizierung bis auf Spezies-Level möglich. Zweitens werden die großen mikrobiellen Gruppen mit real time quantitativer PCR (qPCR) überprüft. In den letzten Jahren wird ein sogenanntes „core microbiom“ für mikrobielle Populationen in unterschiedlichen Habitaten diskutiert. Unser Ziel ist die Verwendung der MALDI-TOF-MS-Technik zur schnellen Charakterisierung von Populationen (auch über das eventuell vorhandene „core microbiom“), um eine schnelle Aussage zum Zustand der Population und eventuelle Einwirkungen auf die physiologische Leistungsfähigkeit machen zu können.

Kontakt:

Prof. Dr. Christianan Cordes