Labor für Molekularbiologie (Sicherheitsstufe 1, S1-Labor)
DNA/RNA Isolation, Mengenbestimmung, Qualitätskontrolle
- Verwendung automatisierter Zell- und Gewebeaufschlusssysteme (mechanisch/enzymatisch).
- Isolation von hochreiner DNA und RNA
- Konzentrationsbestimmung mittels NanoDrop Spektralphotometer bzw. Qubit Fluorometer
- Qualitätskontrolle mittels Agarose-Gelelektrophorese
Analytik
Restriktionsanalysen, Fragmentanalysen, Klonierung, diverse PCR- und DNA-Sequenzierungstechniken
Anwendungen
DNA:
- DNA-Fingerprinting (intraspezies Variationen mittels SSRs/Mikrosatelliten)
- Lokus-spezifische Marker (Allel-Diskriminierung)
- PCR-Marker (sequence-tagged sites)
- Molekulare Taxonomie (Spezies-Identifizierung Bakterien/Pilze/Oomyceten/Pflanzen)
- DNA-(Meta)Barcoding (Charakterisierung mikrobieller Gemeinschaften, Mikrobiome)
- DNA Sequenzierung (Sanger, Illumina, minION)
- BioInformatik (GALAXY Plattform)
RNA:
- reverse Transcription (mRNA – cDNA)
- qPCR (absolute Quantifizierung mittels Standardkurve) mittels SYBR und TaqMan
- qRT-PCR (Transkriptabundanzen, relative Genexpression mittels Referenzgenen)
- RNAseq (Transkriptomanalysen)
- PCR (Primerentwicklung, Primerwalking, Gen-Identifizierung)
- rRNA (16S, ITS1+2 Sequenzierung)
Technische Ausstattung:
Sterile Sicherheitswerkbänke, (Sicherheitsarbeitsplätze (Abzüge), Gewebe- und Zellaufschlussgeräte, automatisierte DNA-Extraktion, Gelelektrophorese (Agarose, PAA, Kapillar), automatisierte Geldokumentation und Auswertung, konventionelle und real-time PCR, Nanodrop- und Küvetten-Photometer, Fluorometer, Vakuumkonzentrator, Vacuum-Blotting, Fluoreszensmarkierung, ganzjährig nutzbare Gewächshäuser, vollautomatisierte Klimakammern und Klimaschränke, Schüttel- und Wippinkubatoren für Gewebe- und Zellkulturen, Blasensäulen und Rühr-Fermenter für Mikroorganismen, Protein- und DNA-Extraktion, SDS-PAGE, hochauflösende Mikroskope und Fluoreszenzmikroskopie.
Aufgaben und Tätigkeitsbereiche:
- In-vitro Kultur steriler Pflanzen, Gewebekulturen
- Testung Pflanzenwachstum fördernder Mikroorganismen (Rhizosphäre)
- Biologische Düngung und biologischer Pflanzenschutz
- Monitoring pflanzlicher Reaktionen auf Wurzelendophyten, Symbionten
- Nachweis der „Systemisch Induzierten Resistenz“ (ISR und SAR)
- Monitoring von Resistenzgen-Aktivitäten
- Pathogen-Diagnostik / Bioassays
- Entwicklung molekularer Marker
- Sortentestung, Sortenbestimmung
- Charakterisierung von Mikrobiome.
Haben Sie Fragen zu unseren „Molekularbiologischen Systemen“ oder Interesse an einer Kooperation? Dann kontaktieren Sie uns doch einfach!