Vertretungsprof. Dr. Dirk Benndorf

Fachbereich 7 - Angewandte Biowissenschaften und Prozesstechnik

Vertretungsprof. Dr. Dirk Benndorf

Curriculum Vitae

  • geboren im März 1972 in Leipzig.
  • Studium der Biochemie an der Universität Leipzig von 1991-1996.
  • von Juni 1996 bis Juli 2007 wissenschaftlicher Mitarbeiter am Helmholtzzentrum für Umweltforschung - UFZ in den Departments Umweltmikrobiologie und Proteomik.
  • im Juni 2000: Promotion im Fachgebiet Biochemie an der Universität Leipzig. Thema der Dissertation angefertigt am UFZ: Molekulare Mechanismen der Resistenz von Bakterien gegenüber Xenobiotika.
  • seit August 2007 wissenschaftlicher Mitarbeiter am Lehrstuhl für Bioprozesstechnik der Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg in Kooperation mit dem Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme Magdeburg
  • seit Oktober 2019: Vertretungsprofessor Mikrobiologie HS Anhalt.

Forschungsschwerpunkte

  • mikrobielle Gemeinschaften in natürlicher Umgebung (Darm-Mikrobiom, Boden) und technischen Systemen (Biogasanlagen, Abwasseranlagen)
  • Metaproteomanalyse (Massenspektrometrie) und Bioinformatik
  • mikrobieller Stoffwechsel

Ausgewählte Publikationen

  1. Santos, P. M., Benndorf, D. and Sá-Correia, I. (2004). A proteomic analysis of the responses to phenol-induced stress in Pseudomonas putida KT2440. Proteomics 4, 2640-2652.
  2. Benndorf, D., Balcke, G.U., Harms, H. and von Bergen, M. (2007). Functional metaproteome analysis of protein extracts from contaminated soil and groundwater. The ISME Journal 1, 224-234.
  3. Heyer, R., Benndorf, D., Kohrs, F., De Vrieze, J., Boon, N., Hoffmann, M., Rapp, E.,Schlüter, A., Sczyrba, A., Reichl, U. (2016) Proteotyping of biogas plant microbiomes separates biogas plants according to process temperature and reactor type. Biotechnol Biofuels 9,155.
  4. Koch, S., Benndorf, D., Fronk, K., Reichl, U., Klamt, S. (2016) Predicting compositions of microbial communities from stoichiometric models with applications for the biogas process. Biotechnol Biofuels 9,17.
  5. Heyer, R., Schallert, K., Zoun, R., Becher, B., Saake, G., Benndorf, D. (2017) Challenges and perspectives of metaproteomic data analysis. Journal of Biotechnology 261, 24-26.
  6. Scoma, A., Heyer, R., Benndorf, D., Dandyk, C., Rifai, R., Boon, N., Kerckhof, F.-M., Marshall, I., Marietou, A., Malmos, K., Vosegaard, T., Boschker, E., Meysman, F., Vermeir, P., Banat, I. (2019). Reduced TCA cycle rates at high hydrostatic pressure hinder hydrocarbon degradation and obligate oil degraders in deep-sea microbial communities. The ISME Journal 13, 10041018.
  7. Heyer, R., Schallert, K., Siewert, C., Kohrs, F., Greve, J., Maus, I., Klang, J., Klocke, M., Heiermann, M., Hoffmann, M., Püttker, S., Calusinska, M., Zoun, R., Saake, G., Benndorf, D., Reichl, U. (2019). Metaproteome analysis reveals that syntrophy, competition, and phage-host interaction shape microbial communities in biogas plants. Microbiome 7, 69.
    Lehmann, T., Schallert, K., Vilchez-Vargas, R., Benndorf, D., Püttker, S., Sydor, S., Schulz, C., Bechmann, L., Canbay, A., Heidrich, B., Reichl, U., Link, A., Heyer, R. (2019). Journal of Proteomics 201, 93-103.
  8. Heyer, R., Schallert, K., Büdel. A., Zoun, R., Dorl, S., Behne, A, Kohrs, F., Püttker, S., Siewert, C., Muth, T., Saake, G, Reichl, U., Benndorf, D. (2019). A robust and universal metaproteomics workflow for research studies and routine diagnostics within 24 h using phenol extraction, FASP digest, and the MetaProteomeAnalyzer. Front. Microbiol., fmicb.2019.01883.

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